在面對特定工廠進行工廠改善計畫時，環保是工廠改善時必要改善的一環。在取得特定工廠登記証之前，共有5項環保相關的議題，是工廠改善裡環保改善必定審查的項目。
特定工廠改善計畫，就是需要符合一個工廠完全合法的條件。
環保議題在特定工廠改善中，著實重要，影響的是週圍農地的狀況，如果沒有辦法確保週圍農地的保持與維，將無法正式取得特定工廠改善核准。
水污染防治
一個工廠內部，是否使用水，為環保影響的第一要因。如果您的農地工廠未使用任何水源，這裡的使用水源，均指「製造過程」，製造過程中若有使用水，將會評估是否「產生廢水」，廢水處理方式與條件屬性需符合 「水污染防治法第二條第七款之依據」。
在工廠改善階段中，需確認水污染防治的重點為：
- 是否用水?
- 屬於何種用水屬性?
- 屬於哪種用水條件?
- 用水的排放方式?
空氣污染防制
特定工廠改善成為合法工廠，這時工廠即於法規定義中的公私場所。
於公私場所是否有進行固定源使用燃料或環境內關於空氣污染的防制防式進行確認。並需符合法規，主要就是確認不會造成空氣上的污染。所以在工廠改善中，均需確認工廠改善計畫中，依據法規「空氣污染防制法第二十八條第一項」，空氣污染防制的「公私場所固定污染源應符合混燒比例及成分標準之燃料」。
如果本身於特定工廠改善時，並沒有任何混燒則無需針對固定污染源進行許可申請。而不同的製程狀況，則需依製程不同，進行固定污染源是否合乎 「空氣污染防制法第二十四條第一項之第一批至第八批公私場所應申請設置、變更及操作許可之固定污染源」
特定工廠改善階段中，針對空氣染防制的重點為：
- 是否有使用燃料?
- 行業別、製程別是否需設置操作許可之固定污染源?
廢棄物清理
只要是工廠，都多少會產生出事業廢棄物。在特定工廠改善階段時，則需針對廢棄物的處理方式，提出符合法規的處理方法。
常見的方式是只要有和外部合格清運業者合作，即可滿足其特定工廠改善廢棄物清運的基本條件之一。
另外需針對其特定工廠改善，需提出事業廢棄物清理計畫書。
環境影響評估
環境影響評估，則是需要針對特定工廠改善階時，針對工廠週圍環境，做整體性的評估與確認。主要就是為了防止過度環境開發，影響週圍環境生態等而進行的實施評估。
在特定工廠改善階段，主要針對工廠自我先行評估為優先標準。以開發行為應實施環境影響評估細目及範圍認定標準為主。
工廠改善自我先行評估的項目很多，主要針以下幾大項目：
- 工廠所在地設立是否影響環境?
- 是否位於台糖土地屬應實施環境影響者?
- 評估前已是先行開發之違規者?
土壤與地下水污染整治
此項工廠改善內容，主要是針對相關土壤與地下水先行評估調查及提供檢測資料。環保署在100年1月3日即公告「土壤及地下水污染整治法第九條第一項之事業」。
在提出之前需確認事業是否符合相關公告之條件，並於特定工廠改善計畫中註明之。
結論與我們的觀點
以上是特定工廠改善時，針對環保改善時需進行相關要求。統一由各地方政府環保局進行相關審查。審查後即通知申請人環保相關的判定結果。
特定工廠就是目前法規上，開出給農地工廠合法化的唯一途徑。
如果你已是完成特定工廠納管之工廠，在接下來的工廠改善計畫上，就需要先行逐步完成工廠改善計畫之書面審核。
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